Наиболее частой причиной эзофагита является заброс кислого содержимого в пищевод, так называемый желудочно-пищеводный рефлюкс, другие причины эзофагита включают в себя различные инфекции.Так же эзофагит может быть вызван под воздействием внешних факторов, таких, как химический ожог.